RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYNGR2	O43760	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSSCA1	O60232	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR137B	O60478	399 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PFDN1	O60925	122 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRLF1	O75462	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFB8	O95169	186 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRH1	P02810	166 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	REG1A	P05451	166 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100A10	P60903	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPCS3	P61009	180 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNB1	P62873	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFA5	Q01523	94 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	FXYD3	Q14802	87 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	TWIST1	Q15672	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNXA	Q16473	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	P2RX4	Q99571	388 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65	3e-10	■■■□□ 16.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGF16	O43320	207 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNAPC5	O75971	98 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTRB1	P17538	263 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRD5A1	P18405	259 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	EDN2	P20800	178 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8N2B8	174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF183	Q96D59	192 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CUBN	O60494	3623 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARPC5	O15511	151 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CST7	O76096	145 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATG12	O94817	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNA17	P01571	189 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHG2	P01859	326 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYGC	P07315	174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAS1L	P35410	378 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	P2RY1	P47900	373 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAS2R30	P59541	319 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	HILS1	P60008	231 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFITM2	Q01629	132 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZSV7	163 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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