RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472897.5

RBM3-205, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 5

Gene RBM3, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-205	ENST00000472897	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	C5orf51	A6NDU8	294 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	FAM25E	A8MYX2	175 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	WRB	O00258	174 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	CTSG	P08311	255 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	OPRK1	P41145	380 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	RAB11A	P62491	216 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	MLANA	Q16655	118 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	RGS21	Q2M5E4	152 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897		Q56UQ5	140 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	REC114	Q7Z4M0	266 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	OR4X1	Q8NH49	305 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	SMIM8	Q96KF7	97 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	PEMT	Q9UBM1	199 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	C7orf66	A4D0T2	115 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	C15orf62	A8K5M9	175 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	SLC25A4	P12235	298 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	TAS2R30	P59541	319 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	IL15RA	Q13261	267 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	RAB40C	Q96S21	281 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	GNG7	O60262	68 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	CLN5	O75503	358 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	TMEM50A	O95807	157 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	IGHV3-48	P01763	117 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	IFNA4	P05014	189 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	ADM	P35318	185 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	NDUFA4	O00483	81 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	SSSCA1	O60232	199 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	SAP30	O75446	220 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	CSN3	P07498	182 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	PAX9	P55771	341 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	CD69	Q07108	199 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897		A8MWP6	167 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	SSNA1	O43805	119 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	SCGB2A1	O75556	95 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	OXA1L	Q15070	435 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	NMES1	Q9C002	83 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	ALG5	Q9Y673	324 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897		K7EPK0	472 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	GOSR2	O14653	212 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	TSC22D2	O75157	780 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	C2orf70	A6NJV1	201 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	PRSS46	E5RG02	174 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897		K7EMT4	169 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	SIX6	O95475	246 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	GAMT	Q14353	236 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	MARC2	Q969Z3	335 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	TMEM213	A2RRL7	107 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897		H3BP45	60 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897		L7N2F9	121 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	IGLC1	P0CG04	106 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	C8orf88	P0DMB2	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	FOLR2	P14207	255 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-205	ENST00000472897	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5

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