RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 COX7A1P24310 79 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 PRR31Q5SQ13 230 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 A0A087X0M5 115 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 A0A1B0GX30 115 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 TSTD3H0UI37 97 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 COX7A2P2O60397 106 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 LY6HO94772 140 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 MMD2Q8IY49 270 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 TMEM18Q96B42 140 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 IL36BQ9NZH7 164 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.65□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.65□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 H3BTX0 84 aa14.65□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 SCGB1D1O95968 90 aa14.65□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 RAB4BP61018 213 aa14.65□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TMEM177Q53S58 311 aa14.65□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.65□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 IGF2RP11717 2491 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 F2Z2F3 143 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 FCN1O00602 326 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 C8orf88P0DMB2 117 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ORM2P19652 201 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ABCA4P78363 2273 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 VSTM5A8MXK1 200 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 AREGP15514 252 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 DDTP30046 118 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TAS2R45P59539 299 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TNXAQ16473 311 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 RPEL1Q2QD12 228 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ABCA1O95477 2261 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 A0A1W2PPI3 338 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 SNURFLB1AK76 121 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 IGLV2-23P01705 113 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TAS2R60P59551 318 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 PKIAP61925 76 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 BLNKQ8WV28 456 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ZNF664Q8N3J9 261 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 C11orf52Q96A22 123 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 V9GYV3 84 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 PCP4P48539 62 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 PDLIM4P50479 330 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TIGITQ495A1 244 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TMEM186Q96B77 213 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 PRR27Q6MZM9 219 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 PDPNQ86YL7 162 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 JKAMPQ9P055 326 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ATRXP46100 2492 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 GNG5P63218 68 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 A0A1W2PN81 502 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 LEMD1Q68G75 181 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 PATE2Q6UY27 113 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 OR5R1Q8NH85 324 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 C9JCJ5 164 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 FNDC10F2Z333 226 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 RANP62826 216 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 PAXXQ9BUH6 204 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 CD3EP07766 207 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 PPOXP50336 477 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 DLX6P56179 175 aa14.59□□□□□ -0.07
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