RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391002.1

SNORD12-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 12, humanhuman

BASIC

Gene SNORD12, Length 90 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD12-201ENST00000391002 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 WFDC11Q8NEX6 87 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 OR13C6PQ8NH95 151 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 CMTM2Q8TAZ6 248 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 DYDC1Q8WWB3 177 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 TMEM106AQ96A25 262 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SLAMF6Q96DU3 332 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 LYSMD1Q96S90 227 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 TXNDC17Q9BRA2 123 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 Q9BRP9 147 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 GINS4Q9BRT9 223 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 C20orf27Q9GZN8 174 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 MIXL1Q9H2W2 232 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 OTORQ9NRC9 128 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 OSTCQ9NRP0 149 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SLC39A9Q9NUM3 307 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 OR52A1Q9UKL2 312 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 DOCK9Q9BZ29 2069 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 DSCAMO60469 2012 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 NLRC5Q86WI3 1866 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 NEO1Q92859 1461 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 RGS12O14924 1447 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 NUP160Q12769 1436 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SETD5Q9C0A6 1442 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 GPR179Q6PRD1 2367 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF532Q9HCE3 1301 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 TRIP11Q15643 1979 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 LCTP09848 1927 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 TRBV19A0A075B6N1 114 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 MEIKINA0A087WXM9 373 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 IRGMA1A4Y4 181 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 MEIS3P1A6NDR6 274 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 OR51F1A6NGY5 319 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 H7C1C5 153 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 J3QRE1 110 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 CYB5BO43169 146 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 GADD45GO95257 159 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 NAPSAO96009 420 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 IFNA21P01568 189 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 PMP2P02689 132 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 IDO1P14902 403 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 S100A4P26447 101 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 CASP1P29466 404 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 PHBP35232 272 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SSR2P43308 183 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 TMEM258P61165 79 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 AP1S1P61966 158 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 DR1Q01658 176 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 RRN3P1Q2M238 152 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 PCOTHQ58A44 107 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SPANXN3Q5MJ09 141 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 ZFAND6Q6FIF0 208 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 DCUN1D2Q6PH85 259 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 Q6ZTI0 123 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 MIR17HGQ75NE6 70 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 AKAP14Q86UN6 197 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 TAC4Q86UU9 113 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 PDZD9Q8IXQ8 264 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 DYNAPQ8N1N2 210 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 FAM24BQ8N5W8 94 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 OR4E2Q8NGC2 313 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 GPR146Q96CH1 333 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 Q96M85 177 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SCGB3A1Q96QR1 104 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SLC50A1Q9BRV3 221 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 PRADC1Q9BSG0 188 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 PBDC1Q9BVG4 233 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 TMEM126AQ9H061 195 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 PARVBQ9HBI1 364 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 MED11Q9P086 117 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SMPXQ9UHP9 88 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 PYCARDQ9ULZ3 195 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 EPDR1Q9UM22 224 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SSR3Q9UNL2 185 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 LHFPL6Q9Y693 200 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 SEC16AO15027 2179 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 DYSFO75923 2080 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD12-201ENST00000391002 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 CACNA1DQ01668 2161 aa0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.3 ms