RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNA1DQ01668 2161 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 POLEQ07864 2286 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 GGTLC3B5MD39 225 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC42EP2O14613 210 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 AGERQ15109 404 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEFF1Q8IYR6 380 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 K7ERJ3 54 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC17A2O00624 439 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 SNCGO76070 127 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 EDNRAP25101 427 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 SGSHP51688 502 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 SGMS2Q8NHU3 365 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 NMES1Q9C002 83 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 RIIAD1A6NNX1 92 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 SCTP09683 121 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CR2P20023 1033 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CD164Q04900 197 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 SPRNQ5BIV9 151 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 IER5LQ5T953 404 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 GTSF1Q8WW33 167 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 BORCS7Q96B45 105 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 DOCK7Q96N67 2140 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM262E9PQX1 116 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFP01375 233 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 HLA-DRB1P01911 266 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2E1P51965 193 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00311Q8N616 119 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 LAMA1P25391 3075 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV18A0A075B6X5 111 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC30A6NM36 301 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 HLA-DQA2P01906 255 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 IL3P08700 152 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 FXYD6P3P58550 94 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 PMAIP1Q13794 54 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 FRG2Q64ET8 278 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 FRG2BQ96QU4 278 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 OARD1Q9Y530 152 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R45P59539 299 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CLLU1OSQ5K130 101 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF13Q92913 245 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF665Q9H7R5 613 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 GNG13Q9P2W3 67 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EMI3 77 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 AMY1AP04745 511 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CD52P31358 61 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 LOXL3P58215 753 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 LTBQ06643 244 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 LMX1AQ8TE12 382 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CYYR1Q96J86 154 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNS1Q96KK3 526 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf77Q96MU5 243 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 V9GY05 133 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP290O15078 2479 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.53□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1CBP62140 327 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf105Q8TEF2 133 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 BRK1Q8WUW1 75 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL6IP5O75915 188 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CDK5R1Q15078 307 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 MCHR1Q99705 422 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDH15Q96QU1 1955 aa5.52□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 OVOL1O14753 267 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 P01737 135 aa5.52□□□□□ -1.53
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