RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 RBP4P02753 201 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 MC5RP33032 325 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRK-216ENST00000524481 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 DERL1Q9BUN8 251 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 VAX2Q9UIW0 290 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRK-216ENST00000524481 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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PTPRK-216ENST00000524481 LINC00869P0C866 280 aa9.46□□□□□ -0.9
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PTPRK-216ENST00000524481 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
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PTPRK-216ENST00000524481 TMEM177Q53S58 311 aa9.45□□□□□ -0.9
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PTPRK-216ENST00000524481 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa9.45□□□□□ -0.9
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PTPRK-216ENST00000524481 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRK-216ENST00000524481 CUBNO60494 3623 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-216ENST00000524481 ZFHX3Q15911 3703 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-216ENST00000524481 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-216ENST00000524481 PYYP10082 97 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-216ENST00000524481 CD69Q07108 199 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-216ENST00000524481 LY6EQ16553 131 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-216ENST00000524481 PRSS8Q16651 343 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.43□□□□□ -0.9
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