RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 ADIRFQ15847 76 aa13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 FAM78BQ5VT40 261 aa13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 ZNF343Q6P1L6 599 aa13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 OR11H6Q8NGC7 330 aa13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 ACACBO00763 2458 aa13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 A6NNC1 897 aa13.43□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 OR51G1Q8NGK1 321 aa13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 DPM3Q9P2X0 92 aa13.43□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 IGSF10Q6WRI0 2623 aa13.43□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PRF3 423 aa13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PRM7 423 aa13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 IGLC7A0M8Q6 106 aa13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 C1orf196B1AJZ1 125 aa13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 FOXH1O75593 365 aa13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 RAB5BP61020 215 aa13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 HCP5Q6MZN7 132 aa13.42□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 NANPQ8TBE9 248 aa13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 FBXL15Q9H469 300 aa13.42□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 NPPCP23582 126 aa13.42□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 COMPP49747 757 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 MIR17HGQ75NE6 70 aa13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 CXorf65A6NEN9 183 aa13.41□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 AREGP15514 252 aa13.41□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 MT-CO2P00403 227 aa13.41□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 PLGLAQ15195 96 aa13.41□□□□□ -0.26
TOM1-216ENST00000492723 ELOBQ15370 118 aa13.41□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 Q8WTZ3 238 aa13.41□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 AKAP6Q13023 2319 aa13.41□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
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TOM1-216ENST00000492723 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 ODF3BA8MYP8 253 aa13.39□□□□□ -0.27
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TOM1-216ENST00000492723 CXCL1P09341 107 aa13.39□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 MMDQ15546 238 aa13.39□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 VMO1Q7Z5L0 202 aa13.39□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 TMEM242Q9NWH2 141 aa13.39□□□□□ -0.27
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TOM1-216ENST00000492723 CLN5O75503 358 aa13.38□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 IGHV2-5P01817 119 aa13.38□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 MFAP2P55001 183 aa13.38□□□□□ -0.27
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TOM1-216ENST00000492723 BIN3Q9NQY0 253 aa13.38□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 CD24P25063 80 aa13.38□□□□□ -0.27
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TOM1-216ENST00000492723 MALSU1Q96EH3 234 aa13.38□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 SSX3Q99909 188 aa13.38□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.38□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 DERL1Q9BUN8 251 aa13.38□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 C19orf24Q9BVV8 132 aa13.38□□□□□ -0.27
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TOM1-216ENST00000492723 TEX22C9J3V5 150 aa13.37□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 ZNF90Q03938 601 aa13.37□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa13.37□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 ZNF114Q8NC26 417 aa13.37□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 TMEM37Q8WXS4 190 aa13.37□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 CFHR4Q92496 578 aa13.37□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 OR5G3P0C626 314 aa13.37□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 SSX2Q16385 188 aa13.37□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 KIR3DL3Q8N743 410 aa13.37□□□□□ -0.27
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