RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZRM9 215 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 OR10C1Q96KK4 312 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 SPATA25Q9BR10 227 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TUBA4BQ9H853 241 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TMEM140Q9NV12 185 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 C5orf51A6NDU8 294 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 FAM25EA8MYX2 175 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 PPP5D1E7EU14 171 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 OR2J3O76001 311 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 OR2A4O95047 310 aa9.55□□□□□ -0.88
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PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-23P01764 117 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 ATP5G2Q06055 141 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa9.55□□□□□ -0.88
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PRAME-212ENST00000485532 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 BET1LQ9NYM9 111 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 CACNG5Q9UF02 275 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 S4R3C0 116 aa9.55□□□□□ -0.88
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PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GW64 132 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 ZNF785A8K8V0 405 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TEX22C9J3V5 150 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 E7EUB6 86 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 UPK2O00526 184 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 CD7P09564 240 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A6P12236 298 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 MYOD1P15172 320 aa9.54□□□□□ -0.88
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PRAME-212ENST00000485532 C2orf50Q96LR7 162 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 OR2A7Q96R45 310 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 NSG2Q9Y328 171 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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PRAME-212ENST00000485532 PITX3O75364 302 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 ACTL6BO94805 426 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 KBTBD11O94819 623 aa9.53□□□□□ -0.88
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PRAME-212ENST00000485532 C15orf32Q32M92 178 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 MMD2Q8IY49 270 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 DEFB125Q8N687 156 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 SPIN2AQ99865 258 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 NEURL2Q9BR09 285 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 PEMTQ9UBM1 199 aa9.53□□□□□ -0.88
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PRAME-212ENST00000485532 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR2C1O95371 312 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 AREGP15514 252 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CD300CQ08708 224 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 AARDQ4LEZ3 155 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR4A5Q8NH83 315 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 GSKIPQ9P0R6 139 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 C2orf70A6NJV1 201 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 C15orf61A6NNL5 157 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CCNKO75909 580 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 SNAPC5O75971 98 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 NDUFB8O95169 186 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 REG1AP05451 166 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 RAP2BP61225 183 aa9.51□□□□□ -0.89
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