RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CHEK1O14757 476 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 IFNA17P01571 189 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 IGKV1-39P01597 117 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 IGKV1D-39P04432 117 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 NPBWR1P48145 328 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.024e-15■□□□□ 8.7
ACTB-212ENST00000484841 PIGPP57054 158 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 ENY2Q9NPA8 101 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-48P01763 117 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 CD5P06127 495 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 RND3P61587 244 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 TNFRSF9Q07011 255 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 RNF183Q96D59 192 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 OR10C1Q96KK4 312 aa14.94□□□□□ -0.02
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ACTB-212ENST00000484841 PI3P19957 117 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 TBPP20226 339 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 TRIM16LQ309B1 348 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 SPINK9Q5DT21 86 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 KLK11Q9UBX7 282 aa14.93□□□□□ -0.02
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ACTB-212ENST00000484841 CSMD3Q7Z407 3707 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 LY6G6CO95867 125 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 PPP5CP53041 499 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 MPTX1A8MV57 137 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 ST8SIA3O43173 380 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 CD3DP04234 171 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 TCF24Q7RTU0 167 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 OR52I2Q8NH67 350 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 CSTL1Q9H114 145 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 TAS2R19P59542 299 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 TP53RKQ96S44 253 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-212ENST00000484841 IGKV1-5P01602 117 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 LYSTQ99698 3801 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 B3GALNT1O75752 331 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 RAB3DO95716 219 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 OPRK1P41145 380 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 ETV6P41212 452 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 SP6Q3SY56 376 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 TERB2Q8NHR7 220 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.033e-13■□□□□ 8.3
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PS18 150 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 RGS5O15539 181 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 GABARAPO95166 117 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 ZNF124Q15973 351 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 ST8SIA2Q92186 375 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 TMEM230Q96A57 120 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 RARRES2Q99969 163 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 A0A0B4J293 547 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 DFFBO76075 338 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 TMEM50AO95807 157 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 NPPCP23582 126 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 GPR107Q5VW38 600 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.036e-17■■■□□ 16.2
ACTB-212ENST00000484841 MEF2DQ14814 521 aa14.85□□□□□ -0.03
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