RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469602.1

SRRT-208, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-208ENST00000469602 CCR6P51684 374 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 SPCS3P61009 180 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 NMSQ5H8A3 153 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 PLET1Q6UQ28 207 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 LGI3Q8N145 548 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 GPR146Q96CH1 333 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 B9D2Q9BPU9 175 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 ENY2Q9NPA8 101 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 TENM3Q9P273 2699 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CENPXA8MT69 81 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 F8W735 103 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 NDUFB6O95139 128 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 MT-CO2P00403 227 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 FOLR2P14207 255 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 VAMP1P23763 118 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 Q56UQ5 140 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 LCN12Q6JVE5 192 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 TXN2Q99757 166 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 TMEM213A2RRL7 107 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CORTO00230 105 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CTSGP08311 255 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 EDN2P20800 178 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CBLN1P23435 193 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 ADMP35318 185 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 MFAP4P55083 255 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CD69Q07108 199 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 PPP1R1AQ13522 171 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 SMCO1Q147U7 214 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 BSXQ3C1V8 233 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 LRTM2Q8N967 370 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 PALMDQ9NP74 551 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 A0A1B0GU03 582 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 NDUFA4O00483 81 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 SFT2D2O95562 160 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 IGHV3-48P01763 117 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 BTCP35070 178 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 HTR2BP41595 481 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 TM4SF20Q53R12 229 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 Q8N1Y9 231 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 MARC2Q969Z3 335 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 PLA2G10O15496 165 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 GNG7O60262 68 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 NXPH3O95157 252 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 C8orf88P0DMB2 117 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 OPRK1P41145 380 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 NPBWR1P48145 328 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 TNFRSF9Q07011 255 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 CCDC32Q9BV29 185 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SRRT-208ENST00000469602 MLXQ9UH92 298 aa7.35□□□□□ -1.23
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