RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 TEX38Q6PEX7 206 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 CORO2AQ92828 525 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 TMEM68Q96MH6 324 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 PLAUP00749 431 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 DEFA6Q01524 100 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 UHRF2Q96PU4 802 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 MT-CO2P00403 227 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 FXYD3Q14802 87 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 SLC25A17O43808 307 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 FAM87AP0C7U9 286 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 ERVFC1-1P60608 527 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 TCL1AP56279 114 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 POU2AF1Q16633 256 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 ZNF503Q96F45 646 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 CENPWQ5EE01 88 aa14.71□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.71□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 NUPR1O60356 82 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 GZMBP10144 247 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 ADMP35318 185 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 WT1-ASQ06250 92 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 BET1LQ9NYM9 111 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 E7EQL1 145 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 HCP5Q6MZN7 132 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 LINC00479Q96M42 142 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 PYYP10082 97 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 CD33P20138 364 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 GNG4P50150 75 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 OR5B3Q8NH48 314 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 NPIPB3Q92617 1050 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 ZZEF1O43149 2961 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 HELTA6NFD8 242 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 GGTLC3B5MD39 225 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 CD69Q07108 199 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 SLC35E1Q96K37 410 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 C2orf83Q53S99 150 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 LINC01560Q8TB33 94 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 TYMSP04818 313 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 CNTFRP26992 372 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 IER3P46695 156 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 LCN2P80188 198 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 C14orf144Q96I85 54 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 CD99P14209 185 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 CGB1A6NKQ9 187 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 MOSP00540 346 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 SGK494Q96LW2 274 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 SHISA9B4DS77 424 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 DLL1O00548 723 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 OR5G3P0C626 314 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 MISP3Q96FF7 219 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 FOXL1Q12952 345 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 SSX2Q16385 188 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS3-202ENST00000460120 TBR1Q16650 682 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms