RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-206ENST00000443528 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTB-206ENST00000443528 OR2T8A6NH00 312 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 CENPXA8MT69 81 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 SPNP16150 400 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 EDN2P20800 178 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 LRTM2Q8N967 370 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 ATP6V0BQ99437 205 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 CCDC32Q9BV29 185 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 BATF3Q9NR55 127 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 PEMTQ9UBM1 199 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 TGOLN2O43493 480 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 NXPH3O95157 252 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 MT-CO2P00403 227 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 SNCAP37840 140 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 BSXQ3C1V8 233 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 DEFB121Q5J5C9 76 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 PLET1Q6UQ28 207 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 C2orf70A6NJV1 201 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 LYRM1O43325 122 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 LY86O95711 162 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 IGHV3-48P01763 117 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 ADMP35318 185 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 SMCO1Q147U7 214 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 S100ZQ8WXG8 99 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 CHRDL1Q9BU40 450 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 ENY2Q9NPA8 101 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 A0A1B0GU03 582 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 ZNF320A2RRD8 509 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 C9orf170A2RU37 121 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 A8MWP6 167 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 CTSGP08311 255 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 GP9P14770 177 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.54e-15■□□□□ 8.7
ACTB-206ENST00000443528 Q56UQ5 140 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 UBAC2Q8NBM4 344 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 TMEM213A2RRL7 107 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 PITX3O75364 302 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 OR4E1P0C645 316 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 FOLR2P14207 255 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 MFAP4P55083 255 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 TNFRSF9Q07011 255 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 TXN2Q99757 166 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 CBLN1P23435 193 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 HTR2BP41595 481 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 DHRS2Q13268 280 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 MLANAQ16655 118 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 TM4SF20Q53R12 229 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 C2orf83Q53S99 150 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 LYG2Q86SG7 212 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 RBKSQ9H477 322 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-206ENST00000443528 CORTO00230 105 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 TCRBP04435 133 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 HOXB5P09067 269 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 SLC25A6P12236 298 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 ZNF846Q147U1 533 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 OR1S1Q8NH92 325 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 NDUFA4O00483 81 aa11.88□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 ADAP1O75689 374 aa11.88□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 C8orf88P0DMB2 117 aa11.88□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 LCN12Q6JVE5 192 aa11.88□□□□□ -0.51
ACTB-206ENST00000443528 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.88□□□□□ -0.51
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