RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212015.10

SIRT1-201, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIRT1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-201ENST00000212015 COX19Q49B96 90 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 CALYQ9NYX4 217 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 A0A1W2PS18 150 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 CCL8P80075 99 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 LOXL4Q96JB6 756 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 WFDC3Q8IUB2 231 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 CCL17Q92583 94 aa14.66□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 PPOXP50336 477 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 TSPOP30536 169 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 Q0VFX4 171 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 PROCRQ9UNN8 238 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 TYMSP04818 313 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.65□□□□□ -0.06
SIRT1-201ENST00000212015 CLDN18P56856 261 aa14.64□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 PRNDQ9UKY0 176 aa14.64□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.64□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 MGST3O14880 152 aa14.64□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.64□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 A0A1W2PN81 502 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 LGALS4P56470 323 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 HES1Q14469 280 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 Q6ZS49 121 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 COQ2Q96H96 371 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 PRRX1P54821 245 aa14.63□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 IGLC2P0DOY2 106 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 IGLC3P0DOY3 106 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 TSKUQ8WUA8 353 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 ASCL2Q99929 193 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 TBR1Q16650 682 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 WDR86Q86TI4 376 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 NIT1Q86X76 327 aa14.62□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 A8MWL6 223 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 K7EN84 100 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 PSG1P11464 419 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 EYSQ5T1H1 3165 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 A0A087X0K7 114 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 GFRA3O60609 400 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 FAM87AP0C7U9 286 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 FAM222BQ8WU58 562 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 CORTO00230 105 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 FXYD7P58549 80 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 WDR82Q6UXN9 313 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.61□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 SLC25A17O43808 307 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 UBE2V1Q13404 147 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 CCL25O15444 150 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 SLAQ13239 276 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 MORN2Q502X0 79 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.6□□□□□ -0.07
SIRT1-201ENST00000212015 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms