RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	NPB	Q8NG41	125 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	COMMD9	Q9P000	198 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM235	A6NFC5	223 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	HOXB5	P09067	269 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR8U9	P0C7N5	309 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	CT45A6	P0DMU7	189 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	CT45A5	P0DMU8	189 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	CT45A7	P0DMV0	189 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ADCYAP1	P18509	176 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	HOXA5	P20719	270 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	LGALS7	P47929	136 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	THBS3	P49746	956 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	TNFRSF9	Q07011	255 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	PLA2G7	Q13093	441 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR2F1	Q13607	317 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ECSCR	Q19T08	205 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF546	Q86UE3	836 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RNF152	Q8N8N0	203 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	TERB2	Q8NHR7	220 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	CYYR1	Q96J86	154 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	HARBI1	Q96MB7	349 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	FBXL15	Q9H469	300 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ACER3-213	ENST00000533873	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PRSS47	A8MTI9	375 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	CCL24	O00175	119 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	SLC25A17	O43808	307 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ACTL6B	O94805	426 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	CNIH1	O95406	144 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	IGLL1	P15814	213 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	RAB5A	P20339	215 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	CNTFR	P26992	372 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PSMB8	P28062	276 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	AKR1C2	P52895	323 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	OR2B8P	P59922	312 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	CX3CL1	P78423	397 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	CFHR3	Q02985	330 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	AKR1C1	Q04828	323 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF345	Q14585	488 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ACTBL2	Q562R1	376 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PYY3	Q5JQD4	70 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ARPC1A	Q92747	370 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	ABHD1	Q96SE0	405 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	PRO1933	Q9H354	126 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TUBA4B	Q9H853	241 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	GAB2	Q9UQC2	676 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	VSIG4	Q9Y279	399 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873		A0A1W2PN81	502 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873		G3V318	75 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV1-16	P04430	117 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ACER3-213	ENST00000533873	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55

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