RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 NECAP1Q8NC96 275 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TVP23CQ96ET8 276 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 GCM1Q9NP62 436 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ABCA1O95477 2261 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 RELNP78509 3460 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 AKAP6Q13023 2319 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 RAB11AP62491 216 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ICAM4Q14773 271 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ZNF726P1Q15940 193 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ZNF709Q8N972 641 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OR4X1Q8NH49 305 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 VAMP8Q9BV40 100 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CALYQ9NYX4 217 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 RNF7Q9UBF6 113 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 WNT2P09544 360 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A16P16260 332 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 MAS1LP35410 378 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 FBLN7Q53RD9 439 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A22Q9H936 323 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 VAX2Q9UIW0 290 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 C16orf97H3BN30 126 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1D-33P01593 117 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1-33P01594 117 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 STAG3L3P0CL85 134 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CD33P20138 364 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 HTD2P86397 168 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CLDND2Q8NHS1 167 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 HINT2Q9BX68 163 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 PLXNB1O43157 2135 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 DPRXA6NFQ7 191 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CLDN34H7C241 214 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS2O15393 492 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 MMP23AO75900 390 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 HBE1P02100 147 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 P0C879 139 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 LOXL3P58215 753 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 BSPH1Q075Z2 132 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CDSNQ15517 529 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 Q8TCH9 128 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 LHX4Q969G2 390 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CST9LQ9H4G1 147 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 RAB29O14966 203 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 LHBP01229 141 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 RANP62826 216 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ACSM6Q6P461 480 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 STPG4Q8N801 248 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OR4A16Q8NH70 328 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 S1PR3Q99500 378 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 IFI27L2Q9H2X8 130 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 JPT1Q9UK76 154 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 LOC105371242A0A075B767 164 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 PPP5D1E7EU14 171 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 GNG7O60262 68 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OPN1MWP04001 364 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 MYOD1P15172 320 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TNFSF4P23510 183 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CFHR2P36980 270 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
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