RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 MT-CO2P00403 227 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00869P0C866 280 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 NPPCP23582 126 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ADIRFQ15847 76 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 HARBI1Q96MB7 349 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 IL3RAP26951 378 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 C11orf52Q96A22 123 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 KALRNO60229 2985 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV2-23P01705 113 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CHRNB4P30926 498 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 GNB1P62873 340 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PPP1R2P9O14990 202 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PPOXP50336 477 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 BTF3L4Q96K17 158 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 TYMSP04818 313 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 GCHFRP30047 84 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CD69Q07108 199 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 CADP27708 2225 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2BKO60814 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2BJP06899 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2BOP23527 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 S100PP25815 95 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2BBP33778 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2BDP58876 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2BCP62807 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM133Q9H2Q1 129 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 H7BYZ3 331 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 IGFBP2P18065 325 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 LGALS7P47929 136 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01551Q86U37 167 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 OR5B12Q96R08 314 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 RNF2Q99496 336 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 FUT9Q9Y231 359 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SVILO95425 2214 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 OR5G3P0C626 314 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 DEFA4P12838 97 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 MYOD1P15172 320 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ATP5G3P48201 142 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 PAX2Q02962 417 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV2-70P01814 119 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 GAMTQ14353 236 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 TRGC2P03986 189 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 GALR1P47211 349 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 LCN2P80188 198 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF841Q6ZN19 808 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF114Q8NC26 417 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 BEND2Q8NDZ0 799 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 C9JCJ5 164 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 TEX45Q8NA69 505 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 CGB1A6NKQ9 187 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV1-47P01700 117 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.8 ms