RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 DEFA4P12838 97 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 CD33P20138 364 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF616Q08AN1 781 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 OXA1LQ15070 435 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 LRTM2Q8N967 370 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD12-202ENST00000406506 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 A0A087WW49 117 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 OR4E1P0C645 316 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 DHRS2Q13268 280 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 C15orf32Q32M92 178 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 SPINK9Q5DT21 86 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 PLET1Q6UQ28 207 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 NUDT15Q9NV35 164 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 C9orf170A2RU37 121 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 LINC01619G3V211 115 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 IFNA17P01571 189 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 OR8U8P0C7N1 319 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 RAB25P57735 213 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 ATP5G2Q06055 141 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 LYG2Q86SG7 212 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 OR2C3Q8N628 320 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 NDUFB8O95169 186 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 MFAP2P55001 183 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 DPF1Q92782 380 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 CYB5BO43169 146 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 TRBV12-3P01733 135 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 SPNP16150 400 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 SMCO1Q147U7 214 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 C4orf46Q504U0 113 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF114Q8NC26 417 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 OR52E5Q8NH55 327 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 SLURP1P55000 103 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 SPCS3P61009 180 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 OR1P1Q8NH06 330 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC140Q96MF4 163 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 MFSD2BA6NFX1 497 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 IGLL1P15814 213 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 THYN1Q9P016 225 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 S4R3C0 116 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD12-202ENST00000406506 A0A1B0GU03 582 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 G3V4G9 280 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 NXPH3O95157 252 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 IGHV3-23P01764 117 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 IL5P05113 134 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 HOXB5P09067 269 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 COQ8AQ8NI60 647 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 CXorf58Q96LI9 332 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 ENY2Q9NPA8 101 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 BMPR1BO00238 502 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 PRAF2O60831 178 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 SLC25A6P12236 298 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 ZP3P21754 424 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 TNFRSF9Q07011 255 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 FAM209BQ5JX69 171 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 OR1S1Q8NH92 325 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD12-202ENST00000406506 DCUN1D4Q92564 292 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms