RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 C4orf46Q504U0 113 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 KCTD9Q7L273 389 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 Q8N1Y9 231 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 DDB2Q92466 427 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 GALNT14Q96FL9 552 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TP53RKQ96S44 253 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 RNF5Q99942 180 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 H0Y980 276 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SPDEFO95238 335 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 APOA2P02652 100 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 OR5AC1P0C628 307 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 APELAP0DMC3 54 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 CATR1Q13166 79 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TMEM187Q14656 261 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SP6Q3SY56 376 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 PDPNQ86YL7 162 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 PRR13Q9NZ81 148 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 CNIH1O95406 144 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 IGLV1-51P01701 117 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TRBV12-3P01733 135 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 CRYGBP07316 175 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 UCP1P25874 307 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 CBX3Q13185 183 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ZNF585BQ52M93 769 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 LYL1P12980 280 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SYNJ2BPP57105 145 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 MITD1Q8WV92 249 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 HARBI1Q96MB7 349 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 ZMAT4Q9H898 229 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 TNCP24821 2201 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 A0A0B4J2A0 478 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 FCGR3BO75015 233 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 B3GALNT1O75752 331 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1-39P01597 117 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1D-39P04432 117 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 ANXA3P12429 323 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DS2P43631 304 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 LPAR6P43657 344 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 TMEM56Q96MV1 263 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SHOXO15266 292 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 S1PR2O95136 353 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 CDS2O95674 445 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SERPINE2P07093 398 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 ZP3P21754 424 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 RTL8BQ17RB0 113 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 CADM3Q8N126 398 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 LGI3Q8N145 548 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 LRTM2Q8N967 370 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 OR4S2Q8NH73 311 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 COQ8AQ8NI60 647 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 CITED4Q96RK1 184 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 PHB2Q99623 299 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 COA4Q9NYJ1 87 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 A0A0G2JLM5 398 aa9.61□□□□□ -0.87
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