RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 XKRY2A2RUG3 117 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 PMS2P11Q13670 270 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 OR52E5Q8NH55 327 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 DPRXA6NFQ7 191 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 GATA4P43694 442 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 EFNB3Q15768 340 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 FAM222BQ8WU58 562 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 DIRC2Q96SL1 478 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 DYSFO75923 2080 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 POLEQ07864 2286 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 LY86O95711 162 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS3-202ENST00000460120 A0A1B0GV90 55 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 CHRNB4P30926 498 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 DLX1P56177 255 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 AARDQ4LEZ3 155 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 PRO1933Q9H354 126 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 C16orf97H3BN30 126 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 PDE6DO43924 150 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 MPDU1O75352 247 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 CXorf1O96002 111 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 STAG3L2P0CL84 134 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 STAG3L3P0CL85 134 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 ADIPOQQ15848 244 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 NEUROG1Q92886 237 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 PFDN5Q99471 154 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 ZNF320A2RRD8 509 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 F6UZH7 168 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 PRRG2O14669 202 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 GAMTQ14353 236 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 A0A1B0GUS0 222 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 GCHFRP30047 84 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 RTL8BQ17RB0 113 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 GFRALQ6UXV0 394 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 PRSS33Q8NF86 280 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 TACC2O95359 2948 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 hADV38S2A0JD32 116 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 FCN3O75636 299 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 OR10J4P0C629 311 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 IL3RAP26951 378 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 HARBI1Q96MB7 349 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 C17orf100A8MU93 164 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 SLC17A3O00476 420 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 OR9G1Q8NH87 305 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 OCC1Q8TAD7 63 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 ACY3Q96HD9 319 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 THBDP07204 575 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 APELAP0DMC3 54 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 RHOBP62745 196 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 RAB31Q13636 194 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 PSG5Q15238 335 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 OR1P1Q8NH06 330 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 RAB1CQ92928 201 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 RAB9BQ9NP90 201 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 E7EUB6 86 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 UPK2O00526 184 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 OR10J1P30954 320 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.79□□□□□ -0.04
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