RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 OR4C12Q96R67 309 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ATP5SQ99766 215 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 CHD8Q9HCK8 2581 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 AKAP6Q13023 2319 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 TRAV17A0A0B4J275 112 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ICAM4Q14773 271 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ZNF146Q15072 292 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ACP7Q6ZNF0 438 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 PIP4P1Q86T03 277 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ZNF709Q8N972 641 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 LFNGQ8NES3 379 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ORAOV1Q8WV07 137 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 SRD5A3Q9H8P0 318 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 PPP5D1E7EU14 171 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ZG16O60844 167 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 VAMP3Q15836 100 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 FBLN7Q53RD9 439 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 DPPA3Q6W0C5 159 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 PCGF1Q9BSM1 259 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 VAMP8Q9BV40 100 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 CLEC18AA5D8T8 446 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 IFNA5P01569 189 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 IGKV3-15P01624 115 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 OCIAD2Q56VL3 154 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 CLEC18CQ8NCF0 446 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ZNRD1Q9P1U0 126 aa12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 FAM27E3Q08E93 113 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ZNF726P1Q15940 193 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 MOGAT3Q86VF5 341 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 SCGB1C1Q8TD33 95 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 RBKSQ9H477 322 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 NCOR2Q9Y618 2525 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 IGHG3P01860 377 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 RPL39P5Q59GN2 51 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 SARAFQ96BY9 339 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 CST9LQ9H4G1 147 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 PROCRQ9UNN8 238 aa12.53□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 A0A1B0GU03 582 aa12.52□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 GATAD1Q8WUU5 269 aa12.52□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 GNG12Q9UBI6 72 aa12.52□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 DSCAMO60469 2012 aa12.52□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 ODAMA1E959 279 aa12.52□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 KLK10O43240 276 aa12.52□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 TAS2R30P59541 319 aa12.52□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 ZNF718Q3SXZ3 478 aa12.52□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 LINC00596Q86U02 117 aa12.52□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 ZNF738Q8NE65 137 aa12.52□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.52□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 PRR33A8MZF0 331 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 IGKV1D-33P01593 117 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 IGKV1-33P01594 117 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 RND2P52198 227 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 ZNF525Q8N782 197 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 SLC25A22Q9H936 323 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 TMEM183BQ1AE95 376 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 OR2V2Q96R30 315 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 CXXC4Q9H2H0 198 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 PLXNB1O43157 2135 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 FCGR3BO75015 233 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 PRDX2P32119 198 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 CDKN1AP38936 164 aa12.51□□□□□ -0.41
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CTIF-205ENST00000587860 Q8IYB0 196 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 ACY3Q96HD9 319 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 OR6C3Q9NZP0 311 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 PROP1O75360 226 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 TFF3Q07654 80 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 WIPI2Q9Y4P8 454 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 HCFC1P51610 2035 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 MYOD1P15172 320 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 ZNF134P52741 427 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 UBE2G2P60604 165 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 SLC38A11Q08AI6 406 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 GUSBP1Q15486 140 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 GCSAMLQ5JQS6 135 aa12.5□□□□□ -0.41
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