RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 LOC105371242A0A075B767 164 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 ZNRF1Q8ND25 227 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 DDB2Q92466 427 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00470Q9BZP3 86 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 PNKDQ8N490 385 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 TTC9CQ8N5M4 171 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 RNF115Q9Y4L5 304 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 SYNGR3O43761 229 aa18.1■□□□□ 0.49
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PTPRM-211ENST00000580170 TIMP4Q99727 224 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa18.1■□□□□ 0.49
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PTPRM-211ENST00000580170 OR11H1Q8NG94 326 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 OR11H2Q8NH07 326 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa18.1■□□□□ 0.49
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PTPRM-211ENST00000580170 MEGF9Q9H1U4 602 aa18.1■□□□□ 0.49
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PTPRM-211ENST00000580170 RIPPLY3P57055 190 aa18.08■□□□□ 0.49
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PTPRM-211ENST00000580170 SPAG17Q6Q759 2223 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 J3QW42 95 aa18.08■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 DNM1P46Q6ZS02 220 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 VCX2Q9H322 139 aa18.08■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 IL36BQ9NZH7 164 aa18.07■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 PROB1E7EW31 1015 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 FAM74A4Q5TZK3 123 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 RAX2Q96IS3 184 aa18.07■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF56Q15929 161 aa18.06■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 SLC17A3O00476 420 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 TYMSP04818 313 aa18.06■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa18.05■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 IFI27L2Q9H2X8 130 aa18.05■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 SCO2A0A1W2PP80 73 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-23P01764 117 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00114Q6XXX2 140 aa18.05■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
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PTPRM-211ENST00000580170 RNF222A6NCQ9 220 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf30Q96GV9 206 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 CKAP5Q14008 2032 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRM-211ENST00000580170 AICDAQ9GZX7 198 aa18.04■□□□□ 0.48
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