RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 HARBI1Q96MB7 349 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A22Q9H936 323 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 WDR83OSQ9Y284 106 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 LY6HO94772 140 aa13.62□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.62□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 SLC24A4Q8NFF2 622 aa13.62□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 OR5AN1Q8NGI8 311 aa13.62□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 OR9G1Q8NH87 305 aa13.62□□□□□ -0.23
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TOM1-216ENST00000492723 TMEM186Q96B77 213 aa13.62□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
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TOM1-216ENST00000492723 NPY1RP25929 384 aa13.62□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 C11orf42Q8N5U0 333 aa13.62□□□□□ -0.23
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TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GX30 115 aa13.61□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 PRSS46E5RG02 174 aa13.61□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 KBTBD11O94819 623 aa13.61□□□□□ -0.23
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TOM1-216ENST00000492723 TMEM133Q9H2Q1 129 aa13.61□□□□□ -0.23
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TOM1-216ENST00000492723 CBLN4Q9NTU7 201 aa13.61□□□□□ -0.23
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TOM1-216ENST00000492723 PRCDQ00LT1 54 aa13.6□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 TMEM177Q53S58 311 aa13.6□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa13.6□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
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TOM1-216ENST00000492723 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa13.59□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 MPDU1O75352 247 aa13.59□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 FSTL3O95633 263 aa13.59□□□□□ -0.23
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TOM1-216ENST00000492723 FKBP11Q9NYL4 201 aa13.59□□□□□ -0.23
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TOM1-216ENST00000492723 PKD1L2Q7Z442 2459 aa13.59□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 H3BQ15 152 aa13.59□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 DEFA4P12838 97 aa13.59□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 PDPNQ86YL7 162 aa13.59□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 OR4C13Q8NGP0 309 aa13.59□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 IFNA1P01562 189 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 ZNF137PP52743 207 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 RAB24Q969Q5 203 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 WASHC3Q9Y3C0 194 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 CYB5BO43169 146 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 RHEBQ15382 184 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 OR8B3Q8NGG8 313 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 OR8B2Q96RD0 313 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 MGST2Q99735 147 aa13.58□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 VAX2Q9UIW0 290 aa13.58□□□□□ -0.24
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TOM1-216ENST00000492723 PPIAL4GP0DN37 164 aa13.57□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 IL3RAP26951 378 aa13.57□□□□□ -0.24
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TOM1-216ENST00000492723 OR5B3Q8NH48 314 aa13.57□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 COMMD5Q9GZQ3 224 aa13.57□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.57□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa13.57□□□□□ -0.24
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TOM1-216ENST00000492723 MIOXQ9UGB7 285 aa13.57□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 PCP4L1A6NKN8 68 aa13.56□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 OPRK1P41145 380 aa13.56□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 RAB13P51153 203 aa13.56□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 OR10W1Q8NGF6 305 aa13.56□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 RAB1CQ92928 201 aa13.56□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
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