RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAST4	O15021	2626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		H0Y980	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMM23	O14925	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB29	O14966	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPFF	O15130	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRAF2	O60831	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCGR3B	O75015	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RGS11	O94810	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	LY6G6D	O95868	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYGB	P07316	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-G	P17693	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBX3	Q13185	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSX2	Q16385	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8N6K4	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0B4J2A0	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PPH5	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		E7EUB6	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCN1	O00602	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOR1A	O14656	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD5L	O43866	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PITX3	O75364	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2A4	O95047	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	VENTX	O95231	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM50A	O95807	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHFR	P00374	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNA2	P01563	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXB5	P09067	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HTR1D	P28221	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	G6PC	P35575	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRRX1	P54821	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	F2RL1	P55085	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAS2R31	P59538	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	EBI3	Q14213	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBY3	A6NI87	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		J3QLI3	93 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOSR2	O14653	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC22A5	O76082	557 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYZL1	O95825	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	THBS3	P49746	956 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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