RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5H14A6NHG9 310 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 K7EQD1 137 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 DYNC1I1O14576 645 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 BIRC5O15392 142 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ORC5O43913 435 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC22O60826 627 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 NXPH4O95158 308 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 C15orf32Q32M92 178 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 LINC01590Q5TEZ4 76 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ERICH5Q6P6B1 374 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 CXorf58Q96LI9 332 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 MROQ9BYG7 248 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 CHST5Q9GZS9 411 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC2A9Q9NRM0 540 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 WASHC3Q9Y3C0 194 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 CDH10Q9Y6N8 788 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa2.74□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 RNF222A6NCQ9 220 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 TNFSF12O43508 249 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 SOX14O95416 240 aa2.74□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 APELAP0DMC3 54 aa2.74□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 KDELR2P33947 212 aa2.74□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 EMP1P54849 157 aa2.74□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 CLINT1Q14677 625 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OXA1LQ15070 435 aa2.74□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 LPCAT4Q643R3 524 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM71F2Q6NXP2 309 aa2.74□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 CLEC19AQ6UXS0 136 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa2.74□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 SSX7Q7RTT5 188 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 VTCN1Q7Z7D3 282 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OR6F1Q8NGZ6 308 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 CNIH3Q8TBE1 160 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OR52B2Q96RD2 323 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 MOB1AQ9H8S9 216 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 NEK6Q9HC98 313 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF586Q9NXT0 402 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 KLK11Q9UBX7 282 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 LAMP5Q9UJQ1 280 aa2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1B0GTI1 187 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 RIIAD1A6NNX1 92 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 H0YJW9 148 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF254O75437 659 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2J3O76001 311 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV1D-12P01611 117 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 C1QBP02746 253 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OCM2P0CE71 109 aa2.73□□□□□ -1.97
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