RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556705.5

SRP54-AS1-204, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 580 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF429Q86V71 674 aa10.17□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SNX29P2Q8IUI4 249 aa10.17□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.17□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR5H2Q8NGV7 314 aa10.17□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 VSTM2AQ8TAG5 236 aa10.17□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPIN2AQ99865 258 aa10.17□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa10.17□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 A0A1B0GW64 132 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TEX22C9J3V5 150 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SAP30O75446 220 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRBV12-3P01733 135 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MYOD1P15172 320 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HLA-DMAP28067 261 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HRH1P35367 487 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TAS2R46P59540 309 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF45Q02386 682 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CATR1Q13166 79 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF343Q6P1L6 599 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR51H1Q8NH63 302 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MOB3AQ96BX8 217 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 USMG5Q96IX5 58 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 COL7A1Q02388 2944 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FAM25AB3EWG3 89 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FAM25CB3EWG5 89 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FAM25GB3EWG6 89 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MAS1LP35410 378 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RHOGP84095 191 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AADACL3Q5VUY0 350 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR4A47Q6IF82 309 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MZT2AQ6P582 158 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GPR141Q7Z602 305 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 B9D2Q9BPU9 175 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SCPEP1Q9HB40 452 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AKIP1Q9NQ31 210 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BET1LQ9NYM9 111 aa10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRAV3A0A0B4J244 114 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CGB1A6NKQ9 187 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 S1PR2O95136 353 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LY86O95711 162 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HPRT1P00492 218 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF735P0CB33 412 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPNP16150 400 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZP3P21754 424 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TAS2R31P59538 309 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RPL8P62917 257 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR6F1Q8NGZ6 308 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HRASLSQ9HDD0 168 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC2A9Q9NRM0 540 aa10.14□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FAM223BA6NKX1 122 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UPK2O00526 184 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR2J3O76001 311 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RLN1P04808 185 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AREGP15514 252 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RPA2P15927 270 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NQO2P16083 231 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HLA-GP17693 338 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TSPAN5P62079 268 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ATP5G2Q06055 141 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CD69Q07108 199 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPCS2Q15005 226 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 POU2AF1Q16633 256 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC25A42Q86VD7 318 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FAM223AQ8IWN6 122 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR4A5Q8NH83 315 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AP3S1Q92572 193 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BORCS5Q969J3 196 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR4C12Q96R67 309 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AIFM2Q9BRQ8 373 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PLEKHA2Q9HB19 425 aa10.13□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GPR31O00270 319 aa10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 F2RP25116 425 aa10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RCVRNP35243 200 aa10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LPAR6P43657 344 aa10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SYNJ2BPP57105 145 aa10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR2B8PP59922 312 aa10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF585BQ52M93 769 aa10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C11orf87Q6NUJ2 197 aa10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.12□□□□□ -0.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CD300LFQ8TDQ1 290 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.8 ms