RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 CNTFRP26992 372 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 F2RL1P55085 397 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 OR4A47Q6IF82 309 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 OR4A5Q8NH83 315 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 COQ8AQ8NI60 647 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 PHB2Q99623 299 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 OR51J1Q9H342 316 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM140Q9NV12 185 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 COA4Q9NYJ1 87 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 ATRQ13535 2644 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A17O43808 307 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 ATG12O94817 140 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 OR2A4O95047 310 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 HLA-DRB1P01911 266 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 G6PCP35575 357 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 RELBQ01201 579 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 FOXL1Q12952 345 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 IL15RAQ13261 267 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 MMDQ15546 238 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 PRSS8Q16651 343 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZRM9 215 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF429Q86V71 674 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM219Q86XT9 240 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 Q8N2B8 174 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 OR4F5Q8NH21 305 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 OR2A7Q96R45 310 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 KIAA1456Q9P272 454 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF580Q9UK33 172 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GU03 582 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GUS0 222 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 C15orf61A6NNL5 157 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 UPK2O00526 184 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 ADAP1O75689 374 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 KRASP01116 189 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 OR9G9P0C7N8 305 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 NDPQ00604 133 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 HNF4GQ14541 408 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 PLGLAQ15195 96 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF695Q8IW36 515 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 GPR146Q96CH1 333 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 FBXL15Q9H469 300 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 PLXNB1O43157 2135 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GW64 132 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 CGB1A6NKQ9 187 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 MPTX1A8MV57 137 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFA7O95182 113 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 HKR1P10072 659 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 AKR1C2P52895 323 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 H2BFSP57053 126 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 ERVK-16P61578 105 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 LIN54Q6MZP7 749 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 MMD2Q8IY49 270 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-207ENST00000454947 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms