RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 SLC35E1Q96K37 410 aa14.91□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 PSG2P11465 335 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 MMP9P14780 707 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 S100A7P31151 101 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 IL13RA2Q14627 380 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM187Q14656 261 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 GPR157Q5UAW9 335 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 DECR2Q9NUI1 292 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 RFNGQ9Y644 331 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 ASCL1P50553 236 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 UCP3P55916 312 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-204ENST00000358923 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 VPS25Q9BRG1 176 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 DYSFO75923 2080 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 MPPED1O15442 326 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 LEAP2Q969E1 77 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 MS4A10Q96PG2 267 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 HES4Q9HCC6 221 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 C12orf77C9JDV5 145 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 IGHV1-46P01743 117 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 NECAP1Q8NC96 275 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 GNB2P62879 340 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TESK1Q15569 626 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FUT9Q9Y231 359 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PRDX2P32119 198 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 EDDM3BP56851 147 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 RANP62826 216 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ADIPOQQ15848 244 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.88□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CD55P08174 381 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ATP6V0CP27449 155 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 KIR2DS4P43632 304 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 KIR2DS1Q14954 304 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 GCM1Q9NP62 436 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 IGLV2-14P01704 120 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 C16orf54Q6UWD8 224 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 Q8IYB0 196 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 LYG1Q8N1E2 194 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.86□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TUSC2O75896 110 aa14.86□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.86□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.86□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.86□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PPBPP02775 128 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 LYNX1G3V0Z9 82 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 HBZP02008 142 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 GYPAP02724 150 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 LYNX1P0DP58 116 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 RBPJQ06330 500 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 KLRB1Q12918 225 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 JKAMPQ9P055 326 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0G2JRQ6 117 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF266Q14584 549 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 TDRG1Q3Y452 100 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CCL13Q99616 98 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.85□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.84□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 UBE2V1Q13404 147 aa14.84□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.84□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 LINC00596Q86U02 117 aa14.84□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.84□□□□□ -0.03
PDE4D-204ENST00000358923 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms