RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478914.1

XRCC6-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, humanhuman

TSL 2

Gene XRCC6, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6-208ENST00000478914 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SPIN2AQ99865 258 aa6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 OR51E2Q9H255 320 aa6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 ZMAT4Q9H898 229 aa6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 ETV7Q9Y603 341 aa6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 COL7A1Q02388 2944 aa6.71□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 DPPA5A6NC42 116 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 FAM223BA6NKX1 122 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 H0Y980 276 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 HLA-DQB1P01920 261 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 KIR2DS2P43631 304 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SYNJ2BPP57105 145 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 DEFA5Q01523 94 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 ATP5G2Q06055 141 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 NEDD8Q15843 81 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 BEST4Q8NFU0 473 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SNAPC3Q92966 411 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 DIABLOQ9NR28 239 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 PEMTQ9UBM1 199 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SPATA2Q9UM82 520 aa6.7□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 A0A0A6YYH2 397 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 A6NJ64 397 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SSX5O60225 188 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 KBTBD11O94819 623 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 OR2A4O95047 310 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 HRASP01112 189 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 IGLV1-51P01701 117 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 MAS1LP35410 378 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 RHOGP84095 191 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 DYRK1AQ13627 763 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 FAM209BQ5JX69 171 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 LCN12Q6JVE5 192 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 RCHY1Q96PM5 261 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 OR2A7Q96R45 310 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.69□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 C3orf84H3BNL1 204 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 AIREO43918 545 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TMEM127O75204 238 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 DHFRP00374 187 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 FCGR2CP31995 323 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 CBX5P45973 191 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 CATR1Q13166 79 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 Q8N402 240 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 MFSD4AQ8N468 514 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 NECAP1Q8NC96 275 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 IFT46Q9NQC8 304 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.68□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.67□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TNFSF12O43508 249 aa6.67□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 PPYP01298 95 aa6.67□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 TRBV12-3P01733 135 aa6.67□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 PRH1P02810 166 aa6.67□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.67□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 FXYD4P59646 89 aa6.67□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 HERV-K104P61576 105 aa6.67□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 MSMO1Q15800 293 aa6.67□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 C15orf32Q32M92 178 aa6.67□□□□□ -1.34
XRCC6-208ENST00000478914 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.67□□□□□ -1.34
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