RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 PLIN1O60240 522 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 MAP3K9P80192 1104 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 OTUD5Q96G74 571 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 CSADQ9Y600 493 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 TNNI2P48788 182 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 KIF22Q14807 665 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2C-208ENST00000617055 TLR2O60603 784 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 CRKP46108 304 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 SPDYE5A6NIY4 337 aa23■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 CETPP11597 493 aa23■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 GYG1P46976 350 aa23■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 GNRH1P01148 92 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC27Q2M243 656 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 BTBD19C9JJ37 291 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 UBE4AQ14139 1066 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 WWC1Q8IX03 1113 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 PRMT2P55345 433 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 BEND3Q5T5X7 828 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 ERO1BQ86YB8 467 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 F6X3S4 739 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 SNAPC2Q13487 334 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2C-208ENST00000617055 IL16Q14005 1332 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 SHISA4Q96DD7 197 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 WRNIP1Q96S55 665 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 GRM8O00222 908 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 IRF6O14896 467 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 CACNB3P54284 484 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 PPIL2Q13356 520 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 GRIK5Q16478 980 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 DPF3Q92784 378 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 MTFR1Q15390 333 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 VAMP4O75379 141 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 C17orf99Q6UX52 265 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 VPS37DQ86XT2 251 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 TEKT1Q969V4 418 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 HOOK2Q96ED9 719 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 CTGFP29279 349 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 PSMC4P43686 418 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 SRRDQ9UH36 339 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 FAM83AQ86UY5 434 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM47Q96LD4 638 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 CPA4Q9UI42 421 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2C-208ENST00000617055 HOXD10P28358 340 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 DCAF15Q66K64 600 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 RAET1EQ8TD07 263 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 OSBPP22059 807 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 GRK4P32298 578 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 PPATQ06203 517 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 GJA8P48165 433 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 MYPNQ86TC9 1320 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2C-208ENST00000617055 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.86■■□□□ 1.25
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