RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRMT2P55345 433 aa22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 CSADQ9Y600 493 aa22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 IFT57Q9NWB7 429 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 BTBD19C9JJ37 291 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 CSF1RP07333 972 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 GJA8P48165 433 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 CETPP11597 493 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 CTGFP29279 349 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 GNAI1P63096 354 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 GJB1P08034 283 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 LRCH3Q96II8 777 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 SRRDQ9UH36 339 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCL5P13501 91 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 GRK4P32298 578 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 PSMC4P43686 418 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 CASP7P55210 303 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 GCKRQ14397 625 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM47Q96LD4 638 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 C17orf99Q6UX52 265 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 TSPYL6Q8N831 410 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAET1EQ8TD07 263 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 CPA4Q9UI42 421 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1W2PPC1 479 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 IRF6O14896 467 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 OSBPP22059 807 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 SNAPC2Q13487 334 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 ERO1BQ86YB8 467 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 RNF208Q9H0X6 261 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 TNNI2P48788 182 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 HOXD10P28358 340 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 G2E3Q7L622 706 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1B0GUL6 1792 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYPNQ86TC9 1320 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 CRKP46108 304 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 WRNIP1Q96S55 665 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 LAMA3Q16787 3333 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLIN1O60240 522 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPIL2Q13356 520 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 STK31Q9BXU1 1019 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 STAP2Q9UGK3 403 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 CACNB3P54284 484 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-209ENST00000616395 EVI5O60447 810 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBXN2AP68543 259 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDHXO00330 501 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 FOXO4P98177 505 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRKCZQ05513 592 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 SGPL1O95470 568 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 GYG1P46976 350 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 GRIK5Q16478 980 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC4A2P04920 1241 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPATQ06203 517 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 LINS1Q8NG48 757 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.21■■□□□ 1.15
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