RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592175.5

KDM4B-210, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 4

Gene KDM4B, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-210ENST00000592175 ATP8B2P98198 1209 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 TFCP2Q12800 502 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 POLA2Q14181 598 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 SSH3Q8TE77 659 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 VEZTQ9HBM0 779 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 A0A1B0GUL7 405 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 SLC10A3P09131 477 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 CCDC102BQ68D86 513 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 UNCXA6NJT0 531 aa20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 PHKA1P46020 1223 aa20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 TNNI2P48788 182 aa20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 TIMM10P62072 90 aa20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 RASA3Q14644 834 aa20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 GRIK5Q16478 980 aa20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 MAP3K11Q16584 847 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 PANK1Q8TE04 598 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 XAGE2Q96GT9 111 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 GPR108Q9NPR9 543 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 ADORA1P30542 326 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 LBX1P52954 281 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 GORABQ5T7V8 394 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 IFFO2Q5TF58 517 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-210ENST00000592175 AOX1Q06278 1338 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 RASGRF1Q13972 1273 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 MOB2Q70IA6 237 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 TNS4Q8IZW8 715 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 PRDX5P30044 214 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 PRKG1Q13976 671 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 CEP85Q6P2H3 762 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 FAM83AQ86UY5 434 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 SLF2Q8IX21 1173 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 HOOK2Q96ED9 719 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 ZIC5Q96T25 663 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.11■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.11■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 PDE3AQ14432 1141 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 TEPSINQ96N21 525 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 CSRNP1Q96S65 589 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 TNNI3KQ59H18 835 aa20.09■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 SPATA5Q8NB90 893 aa20.09■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.09■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.09■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 SREBF2Q12772 1141 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM4B-210ENST00000592175 ABCF2Q9UG63 623 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.4 ms