RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.32■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 SEMA3EO15041 775 aa23.31■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 TEKT1Q969V4 418 aa23.31■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 NF2P35240 595 aa23.3■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 RASGRF1Q13972 1273 aa23.3■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 PRKG1Q13976 671 aa23.3■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.3■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.3■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.3■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 MAST3O60307 1309 aa23.3■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 TNNI3KQ59H18 835 aa23.29■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.29■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.29■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 AOC2O75106 756 aa23.28■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 PRDX5P30044 214 aa23.28■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 MOB2Q70IA6 237 aa23.28■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 BCL11AQ9H165 835 aa23.28■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.27■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.27■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 APBB1O00213 710 aa23.27■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 HMMRO75330 724 aa23.27■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.27■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.27■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 GPR108Q9NPR9 543 aa23.27■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 ABCF2Q9UG63 623 aa23.27■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.26■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 RGMBQ6NW40 437 aa23.26■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.26■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 CACNB3P54284 484 aa23.25■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 RASA3Q14644 834 aa23.25■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.25■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 PI16Q6UXB8 463 aa23.25■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.25■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.25■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.25■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.25■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 FKBP1BP68106 108 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 TNFAIP1Q13829 316 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 SPATA5Q8NB90 893 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 AIDAQ96BJ3 306 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 MRIQ9BWK5 157 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 FZD1Q9UP38 647 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.24■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.23■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.23■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.23■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 SNRKQ9NRH2 765 aa23.23■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.22■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.22■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.22■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.22■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.22■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 MCAMP43121 646 aa23.21■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 TNNI2P48788 182 aa23.21■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 IFFO2Q5TF58 517 aa23.21■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 AACSQ86V21 672 aa23.21■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 CCDC102AQ96A19 550 aa23.21■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.21■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP10-208ENST00000563386 MAP2K2P36507 400 aa23.2■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.2■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.2■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 ZIC5Q96T25 663 aa23.2■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 PCNTO95613 3336 aa23.19■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 ZBTB22O15209 634 aa23.19■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 NOGQ13253 232 aa23.19■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.19■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 WBP1LQ9NX94 342 aa23.19■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 RAI14Q9P0K7 980 aa23.19■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 FOXN1O15353 648 aa23.18■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
USP10-208ENST00000563386 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.2 ms