RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 CALML3P27482 149 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 TRPC3Q13507 836 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ACCSLQ4AC99 568 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 DAAM2Q86T65 1068 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ATP6V1E2Q96A05 226 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 BCAR3O75815 825 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SLFN14P0C7P3 912 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 STMN2Q93045 179 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 MUM1L1Q5H9M0 696 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 MMS19Q96T76 1030 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC122Q5T0U0 273 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 HACE1Q8IYU2 909 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NINLQ9Y2I6 1382 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 RXRBP28702 533 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 IQCA1Q86XH1 822 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC170Q8IYT3 715 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 HACD3Q9P035 362 aa5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 HIF1AQ16665 826 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NCAPGQ9BPX3 1015 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 TIPRLO75663 272 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 VIMP08670 466 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SPA17Q15506 151 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC30Q5VVM6 783 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ATP2A3Q93084 1043 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 TCP10L2B9ZVM9 353 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 DDB1Q16531 1140 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 KRT13P13646 458 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC6Q16204 474 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC102AQ96A19 550 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SSFA2P28290 1259 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PRKCQQ04759 706 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 VPS36Q86VN1 386 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PANK3Q9H999 370 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.9□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 SERPIND1P05546 499 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 PYGMP11217 842 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 EHHADHQ08426 723 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 AZI2Q9H6S1 392 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 MYL1P05976 194 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 USTQ9Y2C2 406 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 CACNA1DQ01668 2161 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 MYL3P08590 195 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 NASPP49321 788 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 MIIPQ5JXC2 388 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 NPM3O75607 178 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 CASQ1P31415 396 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 GNAI1P63096 354 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 DEUP1Q05D60 604 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 KYNUQ16719 465 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 SCRIBQ14160 1630 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 ABL2P42684 1182 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF449Q6P9G9 518 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 ST7Q9NRC1 585 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 KIF28PB7ZC32 967 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 CAPN9O14815 690 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 MAP3K12Q12852 859 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 CALML4Q96GE6 196 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 FAM161BQ96MY7 647 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 CDK19Q9BWU1 502 aa5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ZBED6-202ENST00000550078 SLMAPQ14BN4 828 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms