RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527109.5

RPS2-205, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,030 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-205	ENST00000527109	CRK	P46108	304 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPS2-205	ENST00000527109	SLFN5	Q08AF3	891 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPS2-205	ENST00000527109	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPS2-205	ENST00000527109	TEPSIN	Q96N21	525 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPS2-205	ENST00000527109	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	PDE8B	O95263	885 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	BCAM	P50895	628 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	VPS37D	Q86XT2	251 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	ALDH1A1	P00352	501 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	CACNB3	P54284	484 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	INHBE	P58166	350 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	TNFAIP1	Q13829	316 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	ELP3	Q9H9T3	547 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	UNCX	A6NJT0	531 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	PTPN18	Q99952	460 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	CENPF	P49454	3210 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	FGFR2	P21802	821 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPS2-205	ENST00000527109	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	OPTN	Q96CV9	577 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	CRHR2	Q13324	411 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	EYA2	O00167	538 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	TEKT1	Q969V4	418 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	CAP1	Q01518	475 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	VGLL4	Q14135	290 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	TRIM17	Q9Y577	477 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RPS2-205	ENST00000527109	TNNI2	P48788	182 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	32.07	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	SLC34A2	O95436	690 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	KIF16B	Q96L93	1317 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	MAP3K9	P80192	1104 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	SIL1	Q9H173	461 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	SLC5A1	P13866	664 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	LPIN2	Q92539	896 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	OTUD5	Q96G74	571 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	MRI	Q9BWK5	157 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	BRCA2	P51587	3418 aa		32.01	■■■□□ 2.72
RPS2-205	ENST00000527109	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		32	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	CCL15	Q16663	113 aa		32	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		32	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	CSAD	Q9Y600	493 aa		32	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	AK9	Q5TCS8	1911 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	ERO1A	Q96HE7	468 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	MAST3	O60307	1309 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	FAM83A	Q86UY5	434 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	SP3	Q02447	781 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	ATP2B3	Q16720	1220 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	WRNIP1	Q96S55	665 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	GTF2A2	P52657	109 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	PRDX5	P30044	214 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	EFCC1	Q9HA90	598 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-205	ENST00000527109	CIAO1	O76071	339 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RPS2-205	ENST00000527109	MEIS3	Q99687	375 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RPS2-205	ENST00000527109	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RPS2-205	ENST00000527109	POTEF	A5A3E0	1075 aa		31.93	■■■□□ 2.7

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms