RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 CNBD1Q8NA66 436 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ASB16Q96NS5 453 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 MTFR1LQ9H019 292 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SRGAP3O43295 1099 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ICMTO60725 284 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTPREP23469 700 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ST5P78524 1137 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PAPPAQ13219 1627 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CEP85Q6P2H3 762 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 RETREG3Q86VR2 466 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ATP10DQ9P241 1426 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 C5P01031 1676 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A0G2JLW4 131 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 H3BRB1 525 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 NUDT7P0C024 238 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAPK1P28482 360 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PDE6BP35913 854 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC4A3P48751 1232 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 DPYDQ12882 1025 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRIM50Q86XT4 487 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SSH3Q8TE77 659 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 GREM2Q9H772 168 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPON1Q9HCB6 807 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 LY75O60449 1722 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 C4BP0C0L5 1744 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 TJP1Q07157 1748 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 H0YIN7 160 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SMAPO00193 183 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABL1P00519 1130 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ITGA6P23229 1130 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHRNA5P30532 468 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ATP1A2P50993 1020 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CTSWP56202 376 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPS8P62241 208 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 FUT2Q10981 343 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 LYPD8Q6UX82 237 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 OGFOD1Q8N543 542 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC39A7Q92504 469 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 DCTPP1Q9H773 170 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CACNA1FO60840 1977 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 C21orf2O43822 256 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 HMMRO75330 724 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 BBOX1O75936 387 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 DPEP1P16444 411 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 MTX1Q13505 466 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 EML3Q32P44 896 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-205ENST00000519068 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms