RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		9.13	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		9.13	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	OIP5	O43482	229 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	LILRB5	O75023	590 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	BMP6	P22004	513 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	BAG6	P46379	1132 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	PIP4K2B	P78356	416 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	LRRC14	Q15048	493 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	SULF2	Q8IWU5	870 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	PPME1	Q9Y570	386 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		9.12	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	ARNT	P27540	789 aa		9.11	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	9.11	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	CHSY3	Q70JA7	882 aa		9.11	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		9.11	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	9.11	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	LRRC3	Q9BY71	257 aa		9.11	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115		M0R082	166 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	LMNB1	P20700	586 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	BCR	P11274	1271 aa		9.09	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	RASIP1	Q5U651	963 aa		9.09	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		9.09	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	BTBD6	Q96KE9	485 aa		9.09	□□□□□ -0.95
ETV1-223	ENST00000497115	SOX9	P48436	509 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	ARL4D	P49703	201 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	MSL1	Q68DK7	614 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	PDZD3	Q86UT5	571 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	STK35	Q8TDR2	534 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	9.08	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		9.08	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM37	O94972	964 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	APOBR	Q0VD83	1088 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	UBP1	Q9NZI7	540 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		9.07	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	FAM221A	A4D161	298 aa		9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	FSCN2	O14926	492 aa		9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	F13A1	P00488	732 aa		9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	CYP11A1	P05108	521 aa		9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	CRK	P46108	304 aa		9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	MPP2	Q14168	576 aa		9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	ILDR2	Q71H61	639 aa		9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		9.06	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	LINC01387	J3KSC0	135 aa		9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	CILP	O75339	1184 aa		9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	GSTM4	Q03013	218 aa		9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	NKD1	Q969G9	470 aa		9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	CBX8	Q9HC52	389 aa		9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	KRT82	Q9NSB4	513 aa		9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	GINM1	Q9NU53	330 aa		9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		9.05	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	NID1	P14543	1247 aa		9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	RBL2	Q08999	1139 aa		9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	SEPT6	Q14141	434 aa		9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		9.04	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	TM4SF5	O14894	197 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ETV1-223	ENST00000497115	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms