RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	LARGE1	O95461	756 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	AVP	P01185	164 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	TFCP2	Q12800	502 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	SYNE4	Q8N205	404 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM227B	Q96M60	508 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		7.02	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0D9SFI3	127 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF223	E7ERA6	249 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	TNFRSF10A	O00220	468 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	DPEP1	P16444	411 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CHRNA5	P30532	468 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ANAPC15	P60006	121 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	TGFB2	P61812	414 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ERFE	Q4G0M1	354 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	XP32	Q5T750	250 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	RUFY3	Q7L099	469 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NLRP10	Q86W26	655 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CNTROB	Q8N137	903 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CNBD1	Q8NA66	436 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM89A	Q96GI7	184 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	SNRK	Q9NRH2	765 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	TCHH	Q07283	1943 aa		7.01	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	MED23	Q9ULK4	1368 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	LAMA4	Q16363	1823 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730		H0YIN7	160 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	PDE6B	P35913	854 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	AK2	P54819	239 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ST5	P78524	1137 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NECTIN1	Q15223	517 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR162	Q16538	588 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC24	Q50LG9	513 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	PARP10	Q53GL7	1025 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	TNNI3K	Q59H18	835 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	EVI5L	Q96CN4	794 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	PANK2	Q9BZ23	570 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NYX	Q9GZU5	481 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF609	O15014	1411 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		7	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NUP98	P52948	1817 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	BRD1	O95696	1058 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNA3	P22001	575 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NLRP3	Q96P20	1036 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CASZ1	Q86V15	1759 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		6.99	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	COL4A1	P02462	1669 aa		6.98	□□□□□ -1.29

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