RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 HOOK2Q96ED9 719 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 RTL9Q8NET4 1388 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 UBE3CQ15386 1083 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SYNE4Q8N205 404 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TMX3Q96JJ7 454 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 RTN1Q16799 776 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 H7C1D1 291 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB7AO95365 584 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TPM2P07951 284 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 CUL5Q93034 780 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA32Q96LK8 384 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 PIM2Q9P1W9 311 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 NFAT5O94916 1531 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 PIK3C2AO00443 1686 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF76P36508 570 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 RUFY3Q7L099 469 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SNX21Q969T3 373 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 NLRP5P59047 1200 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SLC27A2O14975 620 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 FOXO4P98177 505 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TNIP1Q15025 636 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 FERMT3Q86UX7 667 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 GJB2P29033 226 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SLC15A2Q16348 729 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM87BQ96K49 555 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TNFAIP1Q13829 316 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TICAM2Q86XR7 235 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 COA1Q9GZY4 146 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SH2D4AQ9H788 454 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 USP40Q9NVE5 1235 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 AKAP12Q02952 1782 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SEC24BO95487 1268 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM5Q71RC9 77 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0D9SFI3 127 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 STX6O43752 255 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TRAK2O60296 914 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 AK2P54819 239 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 NTSR2O95665 410 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TPM3P06753 285 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 NECAB1Q8N987 351 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 B4E1Z4 1266 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 RPS6KB1P23443 525 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 HSPA4P34932 840 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 GUCY1B3Q02153 619 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 OLFM4Q6UX06 510 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 CHST3Q7LGC8 479 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 RGL2O15211 777 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 CSF1RP07333 972 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SPON1Q9HCB6 807 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 PHLPP1O60346 1717 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 UTYO14607 1347 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-211ENST00000486161 PLSCR1O15162 318 aa9.6□□□□□ -0.87
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