RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 TEPSINQ96N21 525 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 CACNB3P54284 484 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 IFNL1Q8IU54 200 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 FGFR2P21802 821 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 ELP3Q9H9T3 547 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 MYH13Q9UKX3 1938 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 HTTP42858 3142 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 FKTNO75072 461 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 TNFAIP1Q13829 316 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 EYA2O00167 538 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 PTPN18Q99952 460 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 SIL1Q9H173 461 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 INHBEP58166 350 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa15.8■□□□□ 0.12
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PRAME-212ENST00000485532 OPTNQ96CV9 577 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 UNCXA6NJT0 531 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 ALDH1A1P00352 501 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
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PRAME-212ENST00000485532 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 CENPFP49454 3210 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 SLC5A1P13866 664 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 TNNI2P48788 182 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 CAP1Q01518 475 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 VGLL4Q14135 290 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 KIF16BQ96L93 1317 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 LPIN2Q92539 896 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 TRIM17Q9Y577 477 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-212ENST00000485532 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 MAP3K9P80192 1104 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 ATP2B3Q16720 1220 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 OTUD5Q96G74 571 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 MEIS3Q99687 375 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 PRDX5P30044 214 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 DIXDC1Q155Q3 683 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 MRIQ9BWK5 157 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 AK9Q5TCS8 1911 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 MAST3O60307 1309 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 ADORA1P30542 326 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 PHKA1P46020 1223 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 CCL15Q16663 113 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 WDR66Q8TBY9 1149 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 WRNIP1Q96S55 665 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 TNNQ9UQP3 1299 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 CSADQ9Y600 493 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 CIAO1O76071 339 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 TCP10Q12799 353 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 FAM83AQ86UY5 434 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.73■□□□□ 0.11
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