RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 BMP6P22004 513 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 CRKP46108 304 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP2K3P46734 347 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 GAS6Q14393 721 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC14Q15048 493 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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RABGGTB-207ENST00000470201 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.97□□□□□ -1.29
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RABGGTB-207ENST00000470201 TTC9Q92623 222 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 KLF15Q9UIH9 416 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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RABGGTB-207ENST00000470201 F13A1P00488 732 aa6.96□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 MPP2Q14168 576 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 MBIPQ9NS73 344 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 CABP4P57796 275 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 SERINC3Q13530 473 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 IKBKEQ14164 716 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 NFE2L2Q16236 605 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.95□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ELOA3Q8NG57 546 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 PIF1Q9H611 641 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM221AA4D161 298 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 H3BRJ5 948 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 ETFBP38117 255 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 SEZ6Q53EL9 994 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 CILPO75339 1184 aa6.93□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 EPHA1P21709 976 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 AP3B2Q13367 1082 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 STK35Q8TDR2 534 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 MKL1Q969V6 931 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 SHDQ96IW2 340 aa6.93□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 GGA1Q9UJY5 639 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
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RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF165P49910 485 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 TNNI3KQ59H18 835 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 REC114Q7Z4M0 266 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 PPT2Q9UMR5 302 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
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