RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
OPN3-204ENST00000469376 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
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OPN3-204ENST00000469376 CLIP2Q9UDT6 1046 aa30.22■■■□□ 2.43
OPN3-204ENST00000469376 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa30.21■■■□□ 2.43
OPN3-204ENST00000469376 APPBP2Q92624 585 aa30.21■■■□□ 2.43
OPN3-204ENST00000469376 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.438e-11■□□□□ 9.5
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OPN3-204ENST00000469376 RTEL1Q9NZ71 1219 aa30.21■■■□□ 2.43
OPN3-204ENST00000469376 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.21■■■□□ 2.43
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OPN3-204ENST00000469376 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa30.21■■■□□ 2.43
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OPN3-204ENST00000469376 CHST3Q7LGC8 479 aa30.19■■■□□ 2.42
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OPN3-204ENST00000469376 A0A1W2PQ64 194 aa30.19■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 A0A1W2PQD8 194 aa30.19■■■□□ 2.42
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OPN3-204ENST00000469376 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
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OPN3-204ENST00000469376 TAF7LQ5H9L4 462 aa30.17■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 ADALQ6DHV7 355 aa30.17■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 NRBP1Q9UHY1 535 aa30.17■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 PRC1O43663 620 aa30.17■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 GUCY1B3Q02153 619 aa30.17■■■□□ 2.42
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OPN3-204ENST00000469376 TAF1LQ8IZX4 1826 aa30.16■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 ERVV-1B6SEH8 477 aa30.15■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 BRAPQ7Z569 592 aa30.15■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 C8orf76Q96K31 380 aa30.15■■■□□ 2.42
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OPN3-204ENST00000469376 RPS6KA4O75676 772 aa30.15■■■□□ 2.42
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OPN3-204ENST00000469376 LRMPQ12912 555 aa30.15■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 TXNRD1Q16881 649 aa30.15■■■□□ 2.42
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OPN3-204ENST00000469376 ZAP70P43403 619 aa30.14■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 HLFQ16534 295 aa30.14■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 CEP57L1Q8IYX8 460 aa30.14■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 ZNF710Q8N1W2 664 aa30.14■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.42
OPN3-204ENST00000469376 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa30.14■■■□□ 2.41
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OPN3-204ENST00000469376 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 PROM2Q8N271 834 aa30.14■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 POLR3EQ9NVU0 708 aa30.14■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 GOLGA8BA8MQT2 603 aa30.13■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 LINC00301Q8NCQ3 95 aa30.13■■■□□ 2.41
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OPN3-204ENST00000469376 RIC1Q4ADV7 1423 aa30.13■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 HAND2P61296 217 aa30.12■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 SCARF1Q14162 830 aa30.12■■■□□ 2.41
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OPN3-204ENST00000469376 GPAA1O43292 621 aa30.1■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 CTIFO43310 598 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 ANTXR2P58335 489 aa30.1■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 CCDC144BQ3MJ40 725 aa30.1■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa30.1■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 FAM89AQ96GI7 184 aa30.1■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 AK7Q96M32 723 aa30.1■■■□□ 2.41
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