RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452612.5

TTC28-AS1-217, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 746 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-217ENST00000452612 USP44Q9H0E7 712 aa16.31■□□□□ 0.2
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 ALDH1A1P00352 501 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GJA5P36382 358 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BCAMP50895 628 aa16.3■□□□□ 0.2
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 TMEM39BQ9GZU3 492 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ELP3Q9H9T3 547 aa16.29■□□□□ 0.2
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 UNCXA6NJT0 531 aa16.28■□□□□ 0.2
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TEKT1Q969V4 418 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRIM17Q9Y577 477 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EYA2O00167 538 aa16.25■□□□□ 0.19
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 CRHR2Q13324 411 aa16.25■□□□□ 0.19
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 PTPN18Q99952 460 aa16.25■□□□□ 0.19
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 VGLL4Q14135 290 aa16.24■□□□□ 0.19
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.24■□□□□ 0.19
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-217ENST00000452612 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MAP3K9P80192 1104 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCL15Q16663 113 aa16.21■□□□□ 0.19
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 ERO1AQ96HE7 468 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MYH2Q9UKX2 1941 aa16.21■□□□□ 0.19
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 GTF2A2P52657 109 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CAP1Q01518 475 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SP3Q02447 781 aa16.19■□□□□ 0.18
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ATP2B3Q16720 1220 aa16.19■□□□□ 0.18
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CEP126Q9P2H0 1117 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.19■□□□□ 0.18
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 CIAO1O76071 339 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PRDX5P30044 214 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MEIS3Q99687 375 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EFCC1Q9HA90 598 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PHKA1P46020 1223 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TCP10Q12799 353 aa16.17■□□□□ 0.18
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