RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423945.5

SBDSP1-202, Transcript of SBDS, ribosome maturation factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SBDSP1, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBDSP1-202ENST00000423945 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.11■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 CCDC102BQ68D86 513 aa22.11■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.11■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.1■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 MYO1BO43795 1136 aa22.1■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.1■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 VEZTQ9HBM0 779 aa22.1■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 FZD1Q9UP38 647 aa22.1■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.1■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 SLC10A3P09131 477 aa22.09■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 NOGQ13253 232 aa22.09■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 XAGE2Q96GT9 111 aa22.09■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 MRIQ9BWK5 157 aa22.09■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 PRDX5P30044 214 aa22.08■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 CEP85Q6P2H3 762 aa22.08■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.08■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 AIDAQ96BJ3 306 aa22.08■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.08■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.08■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 SEMA3EO15041 775 aa22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 RASGRF1Q13972 1273 aa22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 PRKG1Q13976 671 aa22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 RASA3Q14644 834 aa22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 TEKT1Q969V4 418 aa22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 CCDC102AQ96A19 550 aa22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.07■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 NF2P35240 595 aa22.06■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.06■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 MAST3O60307 1309 aa22.06■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 LBX1P52954 281 aa22.05■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.05■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.05■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 TEPSINQ96N21 525 aa22.05■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.05■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 COG6Q9Y2V7 657 aa22.05■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.04■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 MS4A1P11836 297 aa22.04■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 CACNB3P54284 484 aa22.04■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.04■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 MAP3K11Q16584 847 aa22.04■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.04■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 OTOFQ9HC10 1997 aa22.04■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.04■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.03■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 TSKSQ9UJT2 592 aa22.03■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.03■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.02■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 TNFAIP1Q13829 316 aa22.02■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 TNNI3KQ59H18 835 aa22.02■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 PI16Q6UXB8 463 aa22.02■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.02■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.02■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 GPR108Q9NPR9 543 aa22.02■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.02■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.02■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.02■■□□□ 1.12
SBDSP1-202ENST00000423945 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 CSRNP1Q96S65 589 aa22.01■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.01■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 BEGAINQ9BUH8 593 aa22■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 LAMB1P07942 1786 aa21.99■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.99■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.99■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF384Q8TF68 577 aa21.99■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.99■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 CAPN15O75808 1086 aa21.98■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 MCAMP43121 646 aa21.98■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.98■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 ABCF2Q9UG63 623 aa21.98■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.98■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 TNNI2P48788 182 aa21.97■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 PDE3AQ14432 1141 aa21.97■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 GORABQ5T7V8 394 aa21.97■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 FAM83AQ86UY5 434 aa21.97■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 SPATA5Q8NB90 893 aa21.97■■□□□ 1.11
SBDSP1-202ENST00000423945 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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