RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.251e-7■■□□□ 11.7
SBNO1-202ENST00000420886 RASSF10A6NK89 507 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 NFE2L2Q16236 605 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 ST5P78524 1137 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC51Q96ER9 411 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CDC23Q9UJX2 597 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SPTLC2O15270 562 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 STX10O60499 249 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 ZBTB16Q05516 673 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 USP19O94966 1318 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 PKP1Q13835 747 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 PLCB4Q15147 1175 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 EVI5O60447 810 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 NLRP12P59046 1061 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 NBPF14Q5TI25 921 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 TSG101Q99816 390 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 NRBP1Q9UHY1 535 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 ATP2B2Q01814 1243 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 FYB2Q5VWT5 728 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.25□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 NECTIN2Q92692 538 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC77Q9BR77 488 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 STXBP3O00186 592 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 POLE2P56282 527 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 LAMB3Q13751 1172 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 PLVAPQ9BX97 442 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SPG7Q9UQ90 795 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 NR1I2O75469 434 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 ATP1A2P50993 1020 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 DNA2P51530 1060 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 MIS12Q9H081 205 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SKIP12755 728 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SESN3P58005 492 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 TULP2O00295 520 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CETN2P41208 172 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 UBXN1Q04323 297 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CUL3Q13618 768 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 TAF11Q15544 211 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CLUL1Q15846 466 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP18Q8N392 663 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC42Q96M95 316 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 KIF2CQ99661 725 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 HAUS1Q96CS2 278 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SAMM50Q9Y512 469 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 AKR1B10O60218 316 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 NEK1Q96PY6 1258 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 Q9H521 79 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 OPHN1O60890 802 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 TMED1Q13445 227 aa7.24□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SCP2P22307 547 aa7.23□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.23□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 PRAG1Q86YV5 1406 aa7.23□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SARM1Q6SZW1 724 aa7.23□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.251e-6■□□□□ 8.4
SBNO1-202ENST00000420886 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.23□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 POLKQ9UBT6 870 aa7.23□□□□□ -1.25
SBNO1-202ENST00000420886 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.23□□□□□ -1.25
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