RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.82■□□□□ 0.92
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PTPRC-206ENST00000413409 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRC-206ENST00000413409 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRC-206ENST00000413409 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
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PTPRC-206ENST00000413409 H7C1W4 665 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRC-206ENST00000413409 ATP2B4P23634 1241 aa20.66■□□□□ 0.9
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