RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
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C4orf48-201ENST00000409248 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.47■■□□□ 1.67
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C4orf48-201ENST00000409248 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.42■■□□□ 1.66
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C4orf48-201ENST00000409248 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.42■■□□□ 1.66
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C4orf48-201ENST00000409248 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.41■■□□□ 1.66
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C4orf48-201ENST00000409248 ABCF2Q9UG63 623 aa25.41■■□□□ 1.66
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C4orf48-201ENST00000409248 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.4■■□□□ 1.66
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C4orf48-201ENST00000409248 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.39■■□□□ 1.66
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C4orf48-201ENST00000409248 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.38■■□□□ 1.65
C4orf48-201ENST00000409248 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.38■■□□□ 1.65
C4orf48-201ENST00000409248 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.38■■□□□ 1.65
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C4orf48-201ENST00000409248 TNNI2P48788 182 aa25.36■■□□□ 1.65
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C4orf48-201ENST00000409248 BCL11AQ9H165 835 aa25.36■■□□□ 1.65
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C4orf48-201ENST00000409248 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.34■■□□□ 1.65
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C4orf48-201ENST00000409248 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.34■■□□□ 1.65
C4orf48-201ENST00000409248 IGSF3O75054 1194 aa25.33■■□□□ 1.65
C4orf48-201ENST00000409248 RASA3Q14644 834 aa25.33■■□□□ 1.65
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C4orf48-201ENST00000409248 VEGFBP49765 207 aa25.32■■□□□ 1.64
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