RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399207.5

SETD4-204, Transcript of SET domain containing 4, human

TSL 3 BASIC

Gene SETD4, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	MAST3	O60307	1309 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	RLBP1	P12271	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	NOG	Q13253	232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	SEMA3E	O15041	775 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	AOC2	O75106	756 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	CRK	P46108	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	TIMM10	P62072	90 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	TFCP2	Q12800	502 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SETD4-204	ENST00000399207		A0A1B0GUL7	405 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	FOXN1	O15353	648 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	PHKA1	P46020	1223 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	CA12	O43570	354 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	TNNI2	P48788	182 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	ADORA1	P30542	326 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	RASA3	Q14644	834 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	GRIK5	Q16478	980 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	SLC10A3	P09131	477 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	PRKG1	Q13976	671 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	LBX1	P52954	281 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	PRDX5	P30044	214 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	AOX1	Q06278	1338 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	HMMR	O75330	724 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SETD4-204	ENST00000399207	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25

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