RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGSF5Q9NSI5 407 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAGE1O75459 146 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP11A1P05108 521 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMNB1P20700 586 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 NME2P22392 152 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIG3P49916 1009 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLRP12P59046 1061 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 PWP1Q13610 501 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf131Q5VYM1 1079 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO11Q86XK2 927 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALNT11Q8NCW6 608 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 CORO1BQ9BR76 489 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP26Q9BXU7 913 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBX8Q9HC52 389 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 F6X3S4 739 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM229AH3BQW9 127 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELNP15502 786 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS26P62854 115 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC14Q15048 493 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 POU4F3Q15319 338 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 ILDR2Q71H61 639 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP48Q86UV5 1035 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 RELL1Q8IUW5 271 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHDC7BQ96G42 594 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCSER2Q9H7U1 834 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPRSQ9NQ92 184 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLL1O00548 723 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAM11O75078 769 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAOBP27338 520 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARNTP27540 789 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE3AQ14432 1141 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF394Q53GI3 561 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHC3Q8NDX5 983 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 STK35Q8TDR2 534 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBASH3BQ8TF42 649 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM74Q96NL1 305 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 RSRP1Q9BUV0 290 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGIF2Q9GZN2 237 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 NRSN2Q9GZP1 204 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 TM4SF5O14894 197 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUOXA2Q1HG44 320 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASIP1Q5U651 963 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGMOQ6ZNB7 445 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACAD11Q709F0 780 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDZD3Q86UT5 571 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF654Q8IZM8 581 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNB2Q92953 911 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACSBG1Q96GR2 724 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHOVQ96L33 236 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNK4Q9NYG8 393 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 TLR6Q9Y2C9 796 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 MINDY4BA8MYZ0 360 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 WISP1O95388 367 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 ECEL1O95672 775 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 APBA3O96018 575 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 PF4P02776 101 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 BMP6P22004 513 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMNB2Q03252 620 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEPT6Q14141 434 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGF2-ASQ6U949 168 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms