RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 PLS1Q14651 629 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-201ENST00000344528 H0YIN7 160 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-201ENST00000344528 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-201ENST00000344528 DEXIO95424 95 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-201ENST00000344528 SYT1P21579 422 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-201ENST00000344528 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-201ENST00000344528 PLVAPQ9BX97 442 aa18.54■□□□□ 0.56
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SH3BP4-201ENST00000344528 PHACTR2O75167 634 aa18.53■□□□□ 0.56
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SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP4-201ENST00000344528 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.5■□□□□ 0.55
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SH3BP4-201ENST00000344528 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 SKILP12757 684 aa18.49■□□□□ 0.55
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SH3BP4-201ENST00000344528 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH1B1P30837 517 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTN2P35609 894 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R2P41236 205 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 GJA3Q9Y6H8 435 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC24BO95487 1268 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 TMX1Q9H3N1 280 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 KDRP35968 1356 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 PLCD1P51178 756 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 CTSWP56202 376 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 LETM2Q2VYF4 491 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 SSH3Q8TE77 659 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 PICK1Q9NRD5 415 aa18.48■□□□□ 0.55
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SH3BP4-201ENST00000344528 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 ELP1O95163 1332 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP135Q66GS9 1140 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 PRPHP41219 470 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 PRDM1O75626 825 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 APBA3O96018 575 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF6P56537 245 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
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