RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.16■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 NCOA7Q8NI08 942 aa21.16■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
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ACTB-201ENST00000331789 F13A1P00488 732 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.14■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 PRC1O43663 620 aa21.14■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 JAK2O60674 1132 aa21.14■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.14■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 CACNA1SQ13698 1873 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 MCM5P33992 734 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 ANTXR2P58335 489 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 AKT1S1Q96B36 256 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.14■□□□□ 0.97
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ACTB-201ENST00000331789 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 CHD4Q14839 1912 aa21.12■□□□□ 0.97
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ACTB-201ENST00000331789 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 INCENPQ9NQS7 918 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 ZMYM6O95789 1325 aa21.11■□□□□ 0.97
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF384Q8TF68 577 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.1■□□□□ 0.97
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ACTB-201ENST00000331789 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 DDX11Q96FC9 970 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
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ACTB-201ENST00000331789 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 CTDNEP1O95476 244 aa21.1■□□□□ 0.97
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ACTB-201ENST00000331789 GPSM2P81274 684 aa21.1■□□□□ 0.97
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ACTB-201ENST00000331789 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
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ACTB-201ENST00000331789 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 USP48Q86UV5 1035 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.09■□□□□ 0.97
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ACTB-201ENST00000331789 TDO2P48775 406 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
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ACTB-201ENST00000331789 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.07■□□□□ 0.96
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ACTB-201ENST00000331789 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.06■□□□□ 0.96
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ACTB-201ENST00000331789 FERMT3Q86UX7 667 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
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ACTB-201ENST00000331789 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 PRDX5P30044 214 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 PPFIA3O75145 1194 aa21.05■□□□□ 0.96
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